Сайт в стадии разработки [Старая версия сайта]
Самый цитируемый биологический институт РФ *
PDF Печать E-mail
Принадлежит к подразделению: Отдел эволюционной биохимии
Руководитель: доктор биологических наук, доцент, Петров Николай Борисович

Лаборатория исследует молекулярную филогению различных групп одноклеточных и многоклеточных животных, исследует происхождение многоклеточности и происхождение глубоководной фауны иглокожих.

 

Основные направления исследований

  1. Молекулярная филогения основных групп одноклеточных эукариот
  2. Молекулярная филогения основных групп многоклеточных животных
  3. Молекулярная филогения заднежгутиковых (Opistokontha) и происхождение многоклеточности
  4. Молекулярная филогения и происхождение глубоководной фауны иглокожих (Echinodermata)

Основные научные достижения

За период с 1995 года

Показано близкое филогенетическое родство пресноводной безмитохондриальной амебы Pelomyxa palustris с аэробными митохондриальными лобозными амебами.

На деревьях генов 18S рРНК P. palustris образует кладу с безмитохондриальными и вторично утратившими митохондрии амебами и амебофлагеллятами Entamoeba, Endolimax nana и Phreatamoeba balamuthi, а также с аэробными лобозными амебами Vannella, Acanthamoeba, Balamuthia и Hartmannella. Это указывает на возможно вторичную природу отсутствия митохондрий у безмитохондриальных организмов и дискредитирует правомочность группировки безмитохондриальных протистов в таксон Archezoa. Irina A. Milyutina et al., Gene, 272, 1-2, P. 131-139, 2001.

С помощью анализа объединенных последовательностей генов SSU рРНК и актина трех главных групп солнечников показана полифилия этой группы и правомочность выделения Rhizaria новой супергруппы амебоидных протистов.

На филогенетических деревьях последовательностей двух генов солнечники группируются со страменопилами (Actinophryida) и с церкозоями (Desmothoracida), либо образуют самостоятельную линию среди протистов. Эти данные подтверждают также существование Rhizaria, супергруппировки в основном амебоидных эукариот, включающую десмоторацидных солнечников, всех радиолярий, Sticholonche, фораминифер, а также разных филозных и ретикулозных амеб и некоторых жгутиконосцев. Nikolaev S.I. et al., Proc Natl Acad. Sci. USA, 101, 21, 8066-8071, 2004.

Определено филогенетическое родство загадочного многожгутикового простейшего Multicilia marina.

Ранее это простейшее рассматривали либо в составе отдельного типа Multiflagellata, либо в составе лобозных амеб. На филогенетическом дереве последовательностей генов 18S рРНК Multicilia marina занимает место в основании группы Conosea (названа по наличию конуса микротрубочек в кинетидах) вместе с другими амебоидными жгутиконосцами (Phalansterium solitarium, Gephyramoeba sp., Filamoeba nolandi и двумя видами неидентифицированных амеб). Эти данные впервые подтверждают монофилию всех амебоидных жгутиконосцев и проясняют место Amebozoa в системе эукариот. Sergey I. Nikolaev et al., International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 56, 6, 1449–1458, 2006.

Определено положение раковинных лобозных амеб в системе амебоидных простейших.

Эта группа оставалась одной из немногих групп одноклеточных эукариот, не находивших своего места на дереве жизни по данным морфологического анализа. Филогенетический анализ последовательностей генов SSU рРНК показал близость этой группы амебоидных простейших к группе, включающей семейства Amoebidae и Hartmannellidae, и позволил установить однократное возникновение твердой раковины в процессе эволюции амебоидных простейших. Sergey I. Nikolaev et al., Protist, Vol. 156, 2, 191-202, 2005.

С помощью анализа последовательностей генов 18S рРНК изучено филогенетическое родство киноринх и приапулид с нематодами, нематоморфными червями и другими основными группами беспозвоночных.

Киноринхи и приапулиды образуют монофилетическую группу Cephalorhyncha и вместе с нематодами, нематоморфными червями, тихоходками и членистоногими образуют группировку близкородственных таксонов, близкую к целомическим животным. Aleshin et al., J. Mol. Evol 47, 597-605, 1998.

Молекулярная филогения генов 18S рРНК нематод показывает, что класс Adenophorea в традиционном понимании парафилетичен.

Влючаемые в него отряды Chromadorida и Desmodorida на филогенетических деревьях генов 18S рРНК образуют монофилетическую группу с комплексом Monhysterida, Plectida и Secernentea. Монофилия этой группы, названной Chromadoria, поддержана особенностями строения 49-ой шпильки вторичной структуры рРНК. Aleshin et al., Russian Journal of Nematology, 6, 2, 175-184, 1998.

 

Обновлено 29.05.2012 17:44
Все статьи
  1. Mikhailov K.V., Tikhonenkov D.V., Janouskovec J., Diakin A.Y., Ofitserov M.V., Mylnikov A.P., Aleshin V.V. (2015) Primary structure of 28S rRNA gene confirms monophyly of free-living heterotrophic and phototrophic apicomplexans (Alveolata). Biochem.-Moscow, 80 (11): 1492-1499. >>

  2. Shubina E.A., Ponomareva E.V., Klimov A.V., Klimova A.V., Kedrova O.S. (2015) Repetitive DNA sequences as an indicator of the level of genetic isolation in fish. Mol. Biol., 49 (3): 358-368. >>

  3. Krylova E.M., Kamenev G.M., Vladychenskaya I.P., Petrov N.B. (2015) Vesicomyinae (Bivalvia: Vesicomyidae) of the Kuril-Kamchatka Trench and adjacent abyssal regions. Deep-Sea Res. Part II-Top. Stud. Oceanogr., 111: 198-209. >>

  4. Shubina E.A., Nikitin M.A., Ponomareva E.V., Goryunov D.V., Gritsenko O.F. (2013) Comparative Study of Genome Divergence in Salmonids with Various Rates of Genetic Isolation. Int. J. Genomics, 2013: . >>

  5. Melnikova M.N., Petrov N.B., Lomov A.A. la Porta N., Politov D.V. (2012) Testing of Microsatellite Primers with Different Populations of Eurasian Spruces Picea abies (L.) Karst. and Picea obovata Ledeb.. Russ. J. Genet., 48 (5): 562-566. >>

  6. Kuravsky M.L., Aleshin V.V., Frishman D., Muronetz V.I. (2011) Testis-specific glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase: origin and evolution. BMC Evolutionary Biology, 11: 160.

  7. Melnikova M.N., Pavlov S.D., Kolesnikov A.A., Petrov N.B. (2010) Screening of population genetic SCAR markers for mykiss Parasalmo (Oncorhynchus) mykiss from Kamchatka. Russian Journal of Genetics, 46 (6): 699-704.

  8. Aleshin V.V., Mikhailov K.V., Konstantinova A.V., Nikitin M.A., Rusin L.Y., Buinova D.A., Kedrova O.S., Petrov N.B. (2009) On the Phylogenetic Position of Insects in the Pancrustacea Clade. Molecular Biology, 43 (5): 804-818.

  9. Aleshin V.V. (2009) Comparative Genomics, Genosystematics, and the Scientific School of AS Antonov. Molecular Biology, 43 (5): 697-700.

  10. Shubina E.A., Ponomareva E.V., Glubokov A.I. (2009) Population Genetic Structure of Walleye Pollock Theragra chalcogramma (Gadidae, Pisces) from the Bering Sea and Sea of Okhotsk. Molecular Biology, 43 (5): 855-866.

  11. Aleshin V.V., Konstantinova A.V., Mikhailov K.V., Nikitin M.A., Petrov N.B. (2007) Do we need many genes for phylogenetic inference?. Biochemistry-Moscow, 72 (12): 1313-1323.

  12. Shubina E.A., Ponomareva E.V., Gritsenko O.F. (2007) Genetic structure of the Salvelinus genus chars from reservoirs of the Kuril Islands. Biochemistry-Moscow, 72 (12): 1331-1348.

  13. Petrov N.B., Pegova A.N., Manylov O.G., Vladychenskaya N.S., Mugue N.S., Aleshin V.V. (2007) Molecular phylogeny of gastrotricha on the basis of a comparison of the 18S rRNA genes: Rejection of the hypothesis of a relationship between gastrotricha and nematoda. Molecular Biology, 41 (3): 445-452.

  14. Shubina E.A., Ponomaryova E.V., Gritzenko O.F. (2006) Population genetic structure of the char species of the Northern Kuril Islands and the rank of the Dolly Varden Char in the system of the genus Salvelinus (Salmonidae : Teleostei). Zhurnal Obshchei Biologii, 67 (4): 280-297.

  15. Zakataeva N.P., Kutukova E.A., Gronskiy S.V., Troshin P.V., Livshits V.A., Aleshin V.V. (2006) Export of metabolites by the proteins of the DMT and RhtB families and its possible role in intercellular communication. Microbiology, 75 (4): 438-448.

  16. Nikolaev S.I., Berney C., Petrov N.B., Mylnikov A.P., Fahrni J.F., Pawlowski J. (2006) Phylogenetic position of Multicilia marina and the evolution of Amoebozoa. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 56: 1449-1458.

  17. Nikolaev S.I., Mitchell E.A.D., Petrov N.B., Berney C., Fahrni J., Pawlowski J. (2005) The testate lobose amoebae (order Arcellinida Kent, 1880) finally find their home within Amoebozoa. Protist, 156 (2): 191-202.

  18. Petrov N.B., Vladychenskaya N.S. (2005) Phylogeny of protostome moulting animals (Ecdysozoa) inferred from 18 and 28S rRNA gene sequences. Molecular Biology, 39 (4): 590-601.

  19. Nikolaev S.I., Mylnikov A.P., Berney C., Fahrni J., Pawlowski J., Aleshin V.V., Petrov N.B. (2004) Molecular phylogenetic analysis places Percolomonas cosmopolitus within heterolobosea: Evolutionary implications. Journal of Eukaryotic Microbiology, 51 (5): 575-581.

  20. Nikolaev S.I., Berney C., Fahrni J.F., Bolivar I., Polet S., Mylnikov A.P., Aleshin V.V., Petrov N.B., Pawlowski J. (2004) The twilight of Heliozoa and rise of Rhizaria, an emerging supergroup of amoeboid eukaryotes. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 101 (21): 8066-8071.

  21. Manylov O.G., Vladychenskaya N.S., Milyutina I.A., Kedrova O.S., Korokhov N.P., Dvoryanchikov G.A., Aleshin V.V., Petrov N.B. (2004) Analysis of 18S rRNA gene sequences suggests significant molecular differences between Macrodasyida and Chaetonotida (Gastrotricha). Molecular Phylogenetics and Evolution, 30 (3): 850-854.

  22. Shubina E.A., Mel'nikova M.N., Glubokov A.I., Mednikov B.M. (2004) Analysis of the genetic structure of northwestern Bering Sea walleye pollock, Theragra chalcogramma. Environmental Biology of Fishes, 69 (1): 177-185.

  23. Tarakanov B.V., Yakovleva A.A., Aleshin V.V. (2004) Characterization of enterobacteria producing the low-molecular-weight antibiotics microcins. Microbiology, 73 (2): 150-155.

  24. Aleshin V.V. (2004) Whether variable cleavage of Enoplida (Nematoda) is primitive? Notes to D.A. Voronov article "Comparative embryology of Nematoda and the law of embryonic similarity". Zhurnal Obshchei Biologii, 65 (1): 74-80.

  25. Pegova A.N., Krasnova E.D., Aleshin V.V. (2004) Evidence from the small and large ribosomal RNA structure suggests that Anoplostoma rectospiculum Gal'tsova, 1976 (Nematoda : Anoplostomatidae) is a member of the superfamily Enoploidea, not Oncholaimoidea. Nematology, 6: 413-421.

  26. Leander B.S., Kuvardina O.N., Aleshin V.V., Mylnikov A.P., Keeling P.J. (2003) Molecular phylogeny and surface morphology of Colpodella edax (Alveolata): Insights into the phagotrophic ancestry of apicomplexans. Journal of Eukaryotic Microbiology, 50 (5): 334-340.

  27. Nikolaev S.I., Berney C., Fahrni J., Mylnikov A.P., Aleshin V.V., Petrov N.B., Pawlowski J. (2003) Gymnophrys cometa and Lecythium sp are core Cercozoa: Evolutionary implications. Acta Protozoologica, 42 (3): 183-190.

  28. Rusin L.Y., Aleshin V.V., Tchesunov A.V., Atrashkevich G.I. (2003) The 18S ribosomal RNA gene of Soboliphyme baturini Petrow, 1930 (Nematoda : Dioctophymida) and its implications for phylogenetic relationships within Dorylaimia. Nematology, 5: 615-628.

  29. Kuvardina O.N., Leander B.S., Aleshin V.V., Myl'nikov A.P., Keeling P.J., Simdyanov T.G. (2002) The phylogeny of colpodellids (alveolata) using small subunit rRNA gene sequences suggests they are the free-living sister group to apicomplexans. Journal of Eukaryotic Microbiology, 49 (6): 498-504.

  30. Petrov N.B., Aleshin V.V. (2002) Conditionally neutral phylogenetic markers of major taxa: A new aspect of the evolution of macromolecules. Russian Journal of Genetics, 38 (8): 877-894.

More articles