Сайт в стадии разработки [Старая версия сайта]
Самый цитируемый биологический институт РФ *

Отдел эволюционной биохимии

Отдел эволюционной биохимии организован в 1965 г. академиком А.Н. Белозерским, который был его руководителем до 1972 г.; после его ухода из жизни отделом с 1973 г. по 2008 г. заведовал проф. А.С. Антонов. После его кончины  отдел возглавляет проф. А.В. Троицкий.

Основные направления научных исследований

Молекулярная филогенетика и эволюционная геномика различных групп животных и растений.

Основные научные достижения отдела

Указано за 2010-2011 гг

  1. При использовании ряда молекулярных маркеров получены новые данные по молекулярной филогенетике, эволюционной геномике и молекулярной биогеографии различных групп животных - термитов рода Anacanthotermes, глубоководных морских ежей отряда Holasteroida, морских звезд рода Asterias и лососевидных рыб, альвеолярных простейших,. и растений – семейств зонтичных и гречишных (покрытосеменные), подпорядка Jungermanniineae (печеночники), Amblystegiaceae  и Schistidium (мхи). Полученные в ходе исследований новые нуклеотидные последовательности внесены в международную базу данных GenBank. В ряде случаев проведено соотнесение морфологических признаков смолекулярно- филогенетическими деревьями, осуществлены переоценки значимости отдельных морфологических признаков как критериев родства и ревизии систематики групп.
  2. Показано гибридогенное происхождение печеночника Barbilophozia rubescens и мха Podperaea baii. Для B. rubescens впервые для печеночников установлен не концертный характер эволюции рДНК, а для мхов гибридизация представителей отдаленных семейств.
  3. Продолжено изучение изменения ряда фракций геномов при дифференцировке лососевых рыб из групп с разной степенью репродуктивной изоляции. Показано, что дивергенция аллопатрических изолятов может быть хорошо прослежена с помощью экспрессируемых последовательностей. Установлена корреляция степени репродуктивной изоляции с количеством видоспецифичных фракций в сателлитной ДНК.
  4. Расширены базы данных последовательностей генов рРНК, а также белок-кодирующих генов и генов, обеспечивающих клеточные взаимодействия у беспозвоночных животных. Получены новые данные по молекулярной филогении отдельных групп жгутиковых простейших, мезозой, брахиопод, двустворчатых моллюсков. Впервые проведены молекулярно-биологические исследования афелидиевых заднежгутиковых неясного систематического положения. Секвенированы гены 18 и 28S рРНК у афелидиевых – паразитов одноклеточных водорослей. Выявлено сестринское положение афелидиевых по отношению к грибам. Полученный результат важен для понимания происхождения царства грибов. Подтверждена монофилия группы Mesozoa и её происхождение от кольчатых червей. Обоснован видовой статус новозеландской популяции глубоководного двустворчатого моллюска Calyptogena tuerkayi, морфологически близкого к японскому виду C. fausta.
  5. Проведено секвенирование и аннотация полного пластидного генома микогетеротрофной орхидеи Neottia nidus-avis. Показано, что у Neottia полностью отсутствуют или представлены псевдогенами гены, продукты которых участвуют в фотосинтезе, однако сохраняются гены рРНК, рибосомных белков, тРНК и некоторые другие. У нефотосинтезирующих видов орхидных в белок-кодирующих генах увеличена скорость накопления синонимичных и несинонимичных нуклотидных замен.
  6. Проведено секвенирование транскриптомов цветков и соцветий двух видов гречихи и проаннотировано >15 тыс. генов. Выявлены гены семейств регуляторных белков с ДНК-связывающимися доменами
  7. Установлена распространенностьTAS3-локусов регуляторных транс-действующих ta-siRNA в различных группах мхов и их отсутствие у представителей их древнейшей линии, Sphagnopsida, а также у плауновидных.

По результатам проведенных исследований сотрудниками отдела в 2010-2011 гг опубликовано 27 статей в научных журналах и сделано 32 сообщения на отечественных и международных конференциях.

Участие в выполнении научно-исследовательских проектов (программ) и грантовая поддержка

Указано за 2010-2011 гг

Проводятся исследования по теме «Геносистематика эукариот» приоритетного научного  направления фундаментальных научных исследований МГУ.

Работа велась также по государственным контрактам ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России»:

  1. Общая биология и генетика. «Генетические факторы дифференцировки и закономерности их эволюции, сопряженной с филогенезом животных и растений»
  2. Общая биология и генетика. «Идентификация генов гречихи, контролирующих развитие цветка и соцветия, и их структурный и функциональный анализ»
  3. Общая биология и генетика. «Общие закономерности организации и микроэволюции геномов в свете генетических основ видообразования у животных и растений»
  4. Общая биология и генетика. «Структура и эволюция геномов органелл в свете филогенетических отношений животных и растений»
  5. Проведение поисковых научно-исследовательских работ в целях развития общероссийской мобильности в области технических и инженерных наук. «Развитие сравнительных методов биоинформационных технологий на основе выявления структурно-функциональных особенностей организации геномов и отдельных генов растений, животных и эукариотических микроорганизмов"

Исследования, проводимые в отделе поддержаны грантами РФФИ:

  • «Общие системы регуляции в функционировании протеома одноклеточных Opisthokonta»
  • «Изменения генома при эволюционном переходе к многоклеточным животным от одноклеточного предка»
  • «Эволюционная геномика криптогамных растений: молекулярная филогенетика и сравнительный анализ микроРНК»
  • «Эволюции пластидных геномов у нефотосинтезирующих растений»

Сотрудничество с российскими и зарубежными научными организациями

Указано за 2010-2011 гг

  • Биологический факультет МГУ
  • Факультет биоинженерии и биоинформатики МГУ
  • Ботанический сад МГУ
  • Главный Ботанический сад им. Н.В.Цицина РАН
  • Институт проблем передачи информации РАН
  • Институт общей генетики РАН
  • Институт молекулярной биологии имени Энгельгардта РАН
  • Ботанический сад-институт Кольского отделения РАН
  • Зоологический институт РАН
  • Ботанический институтРАН
  • Nees-Institute forBiodiversity of Plants, University of Bonn, Germany
  • Canadian Institute for Advanced Research, University of Britich Columbia, Vancouver, Canada

Педагогическая деятельность

Указано за 2010-2011 гг

Отдел участвует в учебном процессе Биологического факультета МГУ на кафедрах зоологии беспозвоночных (курс «Основы систематики и филогении» - проф. Н.Б.Петров, дбн В.В. Алешин) и высших растений (курс «Геносистематика растений» -  А.В. Троицкий). По обоим курсам на базе межкафедральной лаборатории геносистематики, созданной по инициативе А.С. Антонова, сотрудниками отдела проводятся практикумы.

Под руководством сотрудников отдела осуществляются курсовые и дипломные работы, проходят стажировку сотрудники других научных учреждений РФ и СНГ.

Сотрудники отдела участвуют в деятельности  Научно-образовательного центра «Эволюционная геномика и биоинформатика»,  директором которого является зав. отделом А.В.Троицкий.

Подразделения отдела

Все сотрудники отдела

Штатные сотрудники

Материалы раздела

Все статьи
  1. Morozov S.Y., Milyutina I.A., Bobrova V.K., Ryazantsev D.Y., Erokhina T.N., Zavriev S.K., Agranovsky A.A., Solovyev A.G., Troitsky A.V. (2015) Structural evolution of the 4/1 genes and proteins in non-vascular and lower vascular plants. Biochimie, 119: 125-136. >>

  2. Krasnova E.D., Kharcheva A.V., Milyutina I.A., Voronov D.A., Patsaeva S.V. (2015) Study of microbial communities in redox zone of meromictic lakes isolated from the White Sea using spectral and molecular methods. J. Mar. Biol. Assoc. U.K., 95 (8): 1579-1590. >>

  3. Fedosov V.E., Fedorova A.V., Ignatova E.A., Bobrova V.K., Troitsky A.V. (2015) RPS4 and NAD5 sequences indicate the polyphyly of ditrichaceae and parallelisms in the evolution of haplolepidous mosses. Mol. Biol., 49 (6): 890-894. >>

  4. Milyutina I.A., Ignatova E.A., Ignatov M.S., Goryunov D.V., Troitsky A.V. (2015) Structure of intergenic spacer IGS1 of ribosomal operon from Schistidium mosses. Biochem.-Moscow, 80 (11): 1485-1491. >>

  5. Mikhailov K.V., Tikhonenkov D.V., Janouskovec J., Diakin A.Y., Ofitserov M.V., Mylnikov A.P., Aleshin V.V. (2015) Primary structure of 28S rRNA gene confirms monophyly of free-living heterotrophic and phototrophic apicomplexans (Alveolata). Biochem.-Moscow, 80 (11): 1492-1499. >>

  6. Belevich T.A., Ilyash L.V., Milyutina I.A., Logacheva M.D., Goryunov D.V., Troitsky A.V. (2015) Metagenomic analyses of white sea picoalgae: First data. Biochem.-Moscow, 80 (11): 1514-1521. >>

  7. Goryunov D.V., Nagaev B.E., Nikolaev M.Y., Alexeevski A.V., Troitsky A.V. (2015) Moss phylogeny reconstruction using nucleotide pangenome of complete Mitogenome sequences. Biochem.-Moscow, 80 (11): 1522-1527. >>

  8. Baranova M.A., Logacheva M.D., Penin A.A., Seplyarskiy V.B., Safonova Y.Y., Naumenko S.A., Klepikova A.V., Gerasimov E.S., Bazykin G.A., James T.Y., Kondrashov A.S. (2015) Extraordinary Genetic Diversity in a Wood Decay Mushroom. Mol. Biol. Evol., 32 (10): 2775-2783. >>

  9. Markin N.V., Usatov A.V., Logacheva M.D., Azarin K.V., Gorbachenko O.F., Kornienko I.V., Gavrilova V.A., Tihobaeva V.E. (2015) Study of chloroplast DNA polymorphism in the sunflower (Helianthus L.). Russ. J. Genet., 51 (8): 745-751. >>

  10. Klepikova A.V., Logacheva M.D., Dmitriev S.E., Penin A.A. (2015) RNA-seq analysis of an apical meristem time series reveals a critical point in Arabidopsis thaliana flower initiation. BMC Genomics, 16: . >>

  11. Leushkin E.V., Logacheva M.D., Penin A.A., Sutormin R.A., Gerasimov E.S., Kochkina G.A., Ivanushkina N.E., Vasilenko O.V., Kondrashov A.S., Ozerskaya S.M. (2015) Comparative genome analysis of Pseudogymnoascus spp. reveals primarily clonal evolution with small genome fragments exchanged between lineages. BMC Genomics, 16: . >>

  12. Milyutina I.A., Ignatov M.S. (2015) Conserved motifs in the primary and secondary ITS1 structures of bryophytes. Mol. Biol., 49 (3): 348-357. >>

  13. Shubina E.A., Ponomareva E.V., Klimov A.V., Klimova A.V., Kedrova O.S. (2015) Repetitive DNA sequences as an indicator of the level of genetic isolation in fish. Mol. Biol., 49 (3): 358-368. >>

  14. Krylova E.M., Kamenev G.M., Vladychenskaya I.P., Petrov N.B. (2015) Vesicomyinae (Bivalvia: Vesicomyidae) of the Kuril-Kamchatka Trench and adjacent abyssal regions. Deep-Sea Res. Part II-Top. Stud. Oceanogr., 111: 198-209. >>

  15. Evstafieva A.G., Garaeva A.A., Khutornenko A.A., Klepikova A.V., Logacheva M.D., Penin A.A., Novakovsky G.E., Kovaleva I.E., Chumakov P.M. (2014) A sustained deficiency of mitochondrial respiratory complex III induces an apoptotic cell death through the p53-mediated inhibition of pro-survival activities of the activating transcription factor 4. Cell Death Dis., 5: . >>

  16. Terekhanova N.V., Logacheva M.D., Penin A.A., Neretina T.V., Barmintseva A.E., Bazykin G.A., Kondrashov A.S., Mugue N.S. (2014) Fast Evolution from Precast Bricks: Genomics of Young Freshwater Populations of Threespine Stickleback Gasterosteus aculeatus. PLoS Genet., 10 (10): . >>

  17. Vislobokov N.A., Galinskaya T.V., Degtjareva G.V., Valiejo-Roman C.M., Samigullin T.H., Kuznetsov A.N., Sokoloff D.D. (2014) POLLINATION OF VIETNAMESE ASPIDISTRA XUANSONENSIS (ASPARAGACEAE) BY FEMALE CECIDOMYIIDI FLIES: LARVAE OF POLLINATOR FEED ON FERTILE POLLEN IN ANTHERS OF ANTHETIC BISEXUAL FLOWERS. Am. J. Bot., 101 (9): 1519-1531. >>

  18. Gusev O., Suetsugu Y., Cornette R., Kawashima T., Logacheva M.D., Kondrashov A.S., Penin A.A., Hatanaka R., Kikuta S., Shimura S., Kanamori H., Katayose Y., Matsumoto T., Shagimardanova E., Alexeev D., Govorun V., Wisecaver J., Mikheyev A., Koyanagi R., Fujie M., Nishiyama T., Shigenobu S., Shibata T.F., Golygina V., Hasebe M., Okuda T., Satoh N., Kikawada T. (2014) Comparative genome sequencing reveals genomic signature of extreme desiccation tolerance in the anhydrobiotic midge. Nat. Commun., 5: . >>

  19. Nuraliev M.S., Degtjareva G.V., Sokoloff D.D., Oskolski A.A., Samigullin T.H., Valiejo-Roman C.M. (2014) Flower morphology and relationships of Schefflera subintegra (Araliaceae, Apiales): an evolutionary step towards extreme floral polymery. Bot. J. Linnean Soc., 175 (4): 553-597. >>

  20. Krasnova E.D., Pantyulin A.N., Matorin D.N., Todorenko D.A., Belevich T.A., Milyutina I.A., Voronov D.A. (2014) Cryptomonad alga Rhodomonas sp (Cryptophyta, Pyrenomonadaceae) bloom in the redox zone of the basins separating from the White Sea. Microbiology, 83 (3): 270-277. >>

  21. Leushkin E.V., Sutormin R.A., Nabieva E.R., Penin A.A., Kondrashov A.S., Logacheva M.D. (2013) The miniature genome of a carnivorous plant Genlisea aurea contains a low number of genes and short non-coding sequences. BMC Genomics, 14: . >>

  22. Degtjareva G.V., Kljuykov E.V., Samigullin T.H., Valiejo-Roman C.M., Pimenov M.G. (2013) ITS phylogeny of Middle Asian geophilic Umbelliferae-Apioideae genera with comments on their morphology and utility of psbA-trnH sequences. Plant Syst. Evol., 299 (5): 985-1010. >>

  23. Ozerova L.V., Krasnikova M.S., Troitsky A.V., Solovyev A.G., Morozov S.Y. (2013) TAS3 genes for small ta-siARF RNAs in plants belonging to subtribe senecioninae: Occurrence of prematurely terminated RNA precursors. Mol. Genet. Microbiol. Virol., 28 (2): 79-84. >>

  24. Shubina E.A., Nikitin M.A., Ponomareva E.V., Goryunov D.V., Gritsenko O.F. (2013) Comparative Study of Genome Divergence in Salmonids with Various Rates of Genetic Isolation. Int. J. Genomics, 2013: . >>

  25. Huttunen S., Bell N., Bobrova V.K., Buchbender V., Buck W.R., Cox C.J., Goffinet B., Hedenaes L., Ho B.C., Ignatov M.S., Krug M., Kuznetsova O., Milyutina I.A., Newton A., Olsson S., Pokorny L., Shaw J.A., Stech M., Troitsky A., Vanderpoorten A., Quandt D. (2012) Disentangling knots of rapid evolution: origin and diversification of the moss order Hypnales. J. Bryol., 34: 187-211. >>

  26. Degtjareva G.V., Logacheva M.D., Samigullin T.H., Terentieva E.I., Valiejo-Roman C.M. (2012) Organization of chloroplast psbA-trnH intergenic spacer in dicotyledonous angiosperms of the family umbelliferae. Biochem.-Moscow, 77 (9): 1056-1064. >>

  27. Melnikova M.N., Petrov N.B., Lomov A.A. la Porta N., Politov D.V. (2012) Testing of Microsatellite Primers with Different Populations of Eurasian Spruces Picea abies (L.) Karst. and Picea obovata Ledeb.. Russ. J. Genet., 48 (5): 562-566. >>

  28. Degtjareva G.V., Valiejo-Roman C.M., Samigullin T.H., Guara-Requena M., Sokoloff D.D. (2012) Phylogenetics of Anthyllis (Leguminosae: Papilionoideae: Loteae): Partial incongruence between nuclear and plastid markers, a long branch problem and implications for morphological evolution. Mol. Phylogenet. Evol., 62 (2): 693-707. >>

  29. Penin A.A., Logacheva M.D. (2011) Correlation between number and position of floral organs in Arabidopsis. Annals of Botany, 108 (1): 123-131.

  30. Kuravsky M.L., Aleshin V.V., Frishman D., Muronetz V.I. (2011) Testis-specific glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase: origin and evolution. BMC Evolutionary Biology, 11: 160.

More articles