Сайт в стадии разработки [Старая версия сайта]
Самый цитируемый биологический институт РФ *
PDF Печать E-mail
Внутренние страницы
Группа биохимической инженерии
Тематика исследований
Работа со студентами
Научные проекты
Принадлежит к подразделению: Отдел биокинетики
Руководитель: доктор химических наук, в.н.с., Буник Виктория Ивановна

Виктория Буник читает курс лекций «Энзимология: механизмы катализа»  для студентов 3го курса Факультета Биоинженерии и Биоинформатики.

Cкачать программу курса «Энзимология: механизмы катализа»

В работе группы участвуют студенты ФББ и различных кафедр Биологического факультетов МГУ: кафедры ВНД (Высшей Нервной Деятельности), кафедры ФЧиЖ (Физиологии Человека и Животных) и кафедры Биохимии. Студентами выполнены курсовые и дипломные работы по следующим темам:

Курсовые работы

  • 2 курс:
    • Цепкова П.М. (2012, ФББ) "Измерение активности NAD(P)+-зависимых оксидоредуктаз с помощью тетразолиевых солей"
    • Караваева Ю.Е. (2011, ФББ) «Разработка масс-спектрометрического метода количественного определения аминокислот в экстрактах мозга»
    • Меркушина К.В. (2010, ФББ) «Изоферменты 2-оксоглутаратдегидрогеназы в различных структурах мозга»
  • 3 курс:
    • Кулаковская Е.А. (2012, ФЧиЖ БФ) "Исследование влияния острой гипоксии и синтетического анадога 2-оксоглутарата (сукцинилфосфоната) на показатели сердечной деятельности у самок и самцов крыс"
    • Мкртчан Г. В.,  Меркушина К.В. (2011, ФББ) «Влияние метаболического стресса и беременности на тиаминовый пул мозга крыс»
    • Климук Е.И. (2005, ФББ) «Влияние алкоголизации крыс на активность 2-оксоглутаратдегидрогеназного комплекса мозга»
    • Быкова Н. (2005, ФББ) «Влияние алкоголизации крыс на активность 2-оксоглутаратдегидрогеназного комплекса печени»
  • 4 курс:
    • Алешин В.А. (2015, ФББ) "Влияние тиаминовых соединений на ферменты метаболизма глутамата — глутаминсинтазу и глутаматдегидрогеназу"
    • Артюхов А.В. (2015, ФББ) "Действие фосфоновых и фосфиновых аналогов пирувата in vitro и in situ"
    • Мкртчан Г.В. (2012, ФББ) "Исследование роли 2-оксоглутаратдегидрогеназного комплекса мозга в продукции нейромедиатора глутамата"
    • Лошинская А.А. (2011, каф. ФЧиЖ БФ) «Влияние сукцинилфосфоната (синтетического аналога 2-оксоглутарата) на поведение и вегетативный баланс самок крыс при разных функциональных состояниях»
    • Климук Е.И. (2007, ФББ) «Очистка 2-оксоглутаратдегидрогеназного комплекса из мозга крыс и характеристика его ингибирования фосфоновыми аналогами 2-оксоглутарата»
    • Кабышева М. С. (2006, каф. ФЧиЖ БФ) «Изучение активности 2-оксоглутаратдегидрогеназного комплекса мозга в норме и патологии (при алкоголизации)»
    • Ромаш О.Г. (1989, каф. Биохимии БФ) «Выделение альфа-кетоглутаратдегидрогеназы из грудной мышцы голубя и исследование некоторых ее свойств»

Дипломные работы

  • Цепкова П.М. (2015, ФББ) "Биохимическое исследование нового фермента DHTKD1"
  • Мкртчан Г.В. (2012, ФББ) "Тиамин-зависимые белки мозга крысы"
  • Лошинская А.А. (2011, каф. ФЧиЖ БФ) «Влияние синтетического аналога 2-оксоглутарата (сукцинилфосфоната) на поведение и вегетативный баланс крыс »
  • Грозная А.А. (2009, каф. ВНД БФ) «Влияние сукцинилфосфоната на активность 2-оксоглутаратдегидрогеназы в мозге и поведение крыс в норме и при острой алкогольной интоксикации»
  • Климук Е.И. (2008, ФББ) «Выделение 2-оксоглутаратдегидрогеназного комплекса из мозга крыс и характеристика его взаимодействия с фосфоновыми аналогами 2-оксоглутарата»
  • Кабышева М.С. (2007, каф. ВНД БФ) «Влияние специфических ингибиторов 2-оксоглутаратдегидрогеназы на глутамат-зависимую сигнализацию и гиперстимуляцию нейронов»
  • Шубникова А.А. (1995, каф. Биохимии БФ) «Исследование возможности тиоредоксин-зависимой регуляции дегидрогеназ альфа-кетокислот»
  • Ромаш О.Г. (1990, каф. Биохимии БФ) «Влияние лигандов альфа-кетоглутаратдегидрогеназы на инактивацию фермента в ходе реакции»
  • Львова Н.Б. (1988, каф. Биохимии БФ) «Структурные и каталитические особенности формы альфа-кетоглутаратдегидрогеназы с невзаимодействующими активными центрами»
  • Недавние публикации со студентами по результатам дипломных и курсовых работ:

  • Mkrtchyan G., Aleshin V., Parkhomenko Yu., Kaehne T., di Salvo M. L., Parroni A., Contestabile R., Vovk A., Bettendorff L., Bunik V. (2015) Molecular mechanisms of the non-coenzyme action of thiamin in brain: biochemical, structural and pathway analysis. Scientific Reports 5, Article number: 12583 http://www.nature.com/articles/srep12583
  • Aleshin V. A., Artiukhov A. V., Oppermann H., Kazantsev A. V., Lukashev N. V., Bunik V. I. (2015) Mitochondrial impairment may increase cellular NAD(P)H:resazurin oxidoreductase activity, perturbing the NAD(P)H-based viability assays. Cells 4: 427-451
  • Graf A., Trofimova L., Loshinskaja A., Mkrtchyan G., Strokina A., Lovat M., Tylicki A., Strumilo S., Bettendorff L., and Bunik V. Up-regulation of the 2-oxoglutarate dehydrogenase as a stress response. International Journal of Biochemistry and Cell Biology 2012 Jul 17. [Epub ahead of print]
  • Araújo WL, Trofimova L, Mkrtchyan G, Steinhauser D, Krall L, Graf A, Fernie AR, Bunik VI. On the role of the mitochondrial 2-oxoglutarate dehydrogenase complex in amino acid metabolism. Amino Acids. 2012 Sep 15. [Epub ahead of print]

  • Araujo W.L., Trofimova L., Karavaeva Yu., Steinhauser D., Krall L., Fernie A.R., Bunik V.I. (2011) On the role of the mitochondrial 2-oxoglutarate dehydrogenase complex in the amino acid metabolism. Amino Acids, V. 41, Suppl. 1, p. S39, http://www.springerlink.com/content/e5q8023073375k38/
  • Мкртчян Г., Меркушина К., Кудрявцев П., Трофимова Л., Граф А., Буник В. Тиаминовый статуc мозга как индикатор функционального состояния мозга и его ответов на острую гипоксию// Сборник материалов международной интердисциплинарной конференции "Почему Германия? Перспективы международного сотрудничества в науке, образовании, культуре, экономике и политике" 25-28 Мая 2011 г., Санкт-Петербург, Россия, Изд-во СПбГУЭФ 2011, 297 с. ISBN 978-5-7310-2662-8, http://elibrary.finec.ru/materials_files/360077028.pdf#page=197
  • Trofimova L., Lovat M., Groznaya A., Efimova E., Dunaeva T., Maslova M., Graf A., and Bunik V. “Behavioral Impact of the Regulation of the Brain 2-Oxoglutarate Dehydrogenase Complex by Synthetic Phosphonate Analog of 2-Oxoglutarate: Implications into the Role of the Complex in Neurodegenerative Diseases,” International Journal of Alzheimer's Disease, vol. 2010, Article ID 749061, 8 pages, 2010. http://www.sage-hindawi.com/journals/ijad/2010/749061.cta.html
  • Bunik V.I., Kabysheva M.S., Klimuk E.I., Storozhevykh T.P., Pinelis V.G. (2009) Phosphono analogs of 2-oxoglutarate protect cerebellar granule neurons upon glutamate excitotoxicity. Annals N.Y. Acad. Sci., 1171:521-529
  • Kabysheva MS, Storozhevykh TP, Pinelis VG, Bunik V.I. (2009) Synthetic regulators of the 2-oxoglutarate oxidative decarboxylation alleviate the glutamate excitotoxicity in cerebellar granule neurons. Biochem Pharmacol. 77:1531-1540
  • Graf A., Kabysheva M., Storozhevykh T., Pinelis V., Sokolova N., Bunik V.I. (2009) Role of 2-oxoglutarate dehydrogenase in brain pathologies involving glutamate neurotoxicity, J.Molec.Catalysis B: Enzymatic 61: 80-87
Обновлено 26.08.2015 09:50
Все статьи
  1. Mkrtchyan G., Aleshin V., Parkhomenko Y., Kaehne T., Di Salvo M.L., Parroni A., Contestabile R., Vovk A., Bettendorff L., Bunik V. (2015) Molecular mechanisms of the non-coenzyme action of thiamin in brain: biochemical, structural and pathway analysis. Sci Rep, 5: . >>

  2. Diaz-Munoz M.D., Bell S.E., Fairfax K., Monzon-Casanova E., Cunningham A.F., Gonzalez-Porta M., Andrews S.R., Bunik V.I., Zarnack K., Curk T., Heggermont W.A., Heymans S., Gibson G.E., Kontoyiannis D.L., Ule J., Turner M. (2015) The RNA-binding protein HuR is essential for the B cell antibody response. Nat. Immunol., 16 (4): 415-425. >>

  3. Quinlan C.L., Goncalves R.L.S, Hey-Mogensen M., Yadava N., Bunik V.I., Brand M.D. (2014) The 2-Oxoacid Dehydrogenase Complexes in Mitochondria Can Produce Superoxide/Hydrogen Peroxide at Much Higher Rates Than Complex I. J. Biol. Chem., 289 (12): 8312-8325. >>

  4. Bunik V.I., Tylicki A., Lukashev N.V. (2013) Thiamin diphosphate-dependent enzymes: from enzymology to metabolic regulation, drug design and disease models. FEBS J., 280 (24): 6412-6442. >>

  5. Bunik V.I. (2013) Thiamin-dependent enzymes: new perspectives from the interface between chemistry and biology. FEBS J., 280 (24): 6373-6373. >>

  6. Araujo W.L., Trofimova L., Mkrtchyan G., Steinhauser D., Krall L., Graf A., Fernie A.R., Bunik V.I. (2013) On the role of the mitochondrial 2-oxoglutarate dehydrogenase complex in amino acid metabolism. Amino Acids, 44 (2): 683-700. >>

  7. Graf A., Trofimova L., Loshinskaja A., Mkrtchyan G., Strokina A., Lovat M., Tylicky A., Strumilo S., Bettendorff L., Bunik V.I. (2013) Up-regulation of 2-oxoglutarate dehydrogenase as a stress response. Int. J. Biochem. Cell Biol., 45 (1): 175-189. >>

  8. Parkhomenko Y.M., Kudryavtsev P.A., Pylypchuk S.Y., Chekhivska L.I., Stepanenko S.P., Sergiichuk A.A., Bunik V.I. (2011) Chronic alcoholism in rats induces a compensatory response, preserving brain thiamine diphosphate, but the brain 2-oxo acid dehydrogenases are inactivated despite unchanged coenzyme levels. Journal of Neurochemistry, 117 (6): 1055-1065.

  9. Bunik V.I. (2011) Metabolic Networking through Enzymatic Sensing, Signaling and Response to Homeostatic Fluctuations. Cellular Networks - Positioning, Performance Analysis, Reliability, Agassi Melikov (Ed.), : 377-405. >>

  10. Bunik V.I., Schloss J.V., Pinto J.T., Dudareva N., Cooper A.J. (2011) A survey of oxidative paracatalytic reactions catalyzed by enzymes that generate carbanionic intermediates: implications for ROS production, cancer etiology, and neurodegenerative diseases. Adv Enzymol Relat Areas Mol Biol, 77: 307-60.

  11. Tylicki A., Bunik V.I., Strumiеlo S. (2011) 2-Oxoglutarate dehydrogenase complex and its multipoint control. Postepy Biochem, 57 (3): 304-13.

  12. Trofimova L., Lovat M., Groznaya A., Efimova E., Dunaeva T., Maslova M., Graf A., Bunik V. (2010) Behavioral impact of the regulation of the brain 2-oxoglutarate dehydrogenase complex by synthetic phosphonate analog of 2-oxoglutarate: implications into the role of the complex in neurodegenerative diseases. Int J Alzheimers Dis, 2010: 749061.

  13. Van Der Merwe M.J., Osorio S., Arajo W.L., Balbo I., Nunes-Nesi A., Maximova E., Carrari F., Bunik V.I., Persson S., Fernie A.R. (2010) Tricarboxylic acid cycle activity regulates tomato root growth via effects on secondary cell wall production. Plant Physiol, 153 (2): 611-21.

  14. Graf A., Kabysheva M., Klimuk E., Trofimova L., Dunaeva T., Zundorf G., Kahlert S., Reiser G., Storozhevykh T., Pinelis V., Sokolova N., Bunik V. (2009) Role of 2-oxoglutarate dehydrogenase in brain pathologies involving glutamate neurotoxicity. Journal of Molecular Catalysis B-Enzymatic, 61 (1): 80-87.

  15. Bunik V.I., Fernie A.R. (2009) Metabolic control exerted by the 2-oxoglutarate dehydrogenase reaction: a cross-kingdom comparison of the crossroad between energy production and nitrogen assimilation. Biochemical Journal, 422: 405-421.

  16. Bunik V.I., Strumilo S. (2009) Regulation of Catalysis Within Cellular Network: Metabolic and Signaling Implications of the 2-Oxoglutarate Oxidative Decarboxylation. Current Chemical Biology, 3 (3): 279-290. >>

  17. Kabysheva M.S., Storozhevykh T.P., Pinelis V.G., Bunik V.I. (2009) Synthetic regulators of the 2-oxoglutarate oxidative decarboxylation alleviate the glutamate excitotoxicity in cerebellar granule neurons. Biochemical Pharmacology, 77 (9): 1531-1540.

  18. Zundorf G., Kahlert S., Bunik V.I., Reiser G. (2009) Alpha-Ketoglutarate Dehydrogenase Contributes to Production of Reactive Oxygen Species in Glutamate-Stimulated Hippocampal Neurons in Situ. Neuroscience, 158 (2): 610-616.

  19. Bunik V.I., Kabysheva M.S., Klimuk E.I., Storozhevykh T.P., Pinelis V.G. (2009) Phosphono Analogues of 2-Oxoglutarate Protect Cerebellar Granule Neurons upon Glutamate Excitotoxicity. Natural Compounds and Their Role in Apoptotic Cell Signaling Pathways, 1171: 521-529.

  20. Arajo W.L., Nunes-Nesi A., Trenkamp S., Bunik V.I., Fernie A.R. (2008) Inhibition of 2-oxoglutarate dehydrogenase in potato tuber suggests the enzyme is limiting for respiration and confirms its importance in nitrogen assimilation. Plant Physiol, 148 (4): 1782-96.

  21. Bunik V., Kaehne T., Degtyarev D., Shcherbakova T., Reiser G. (2008) Novel isoenzyme of 2-oxoglutarate dehydrogenase is identified in brain, but not in heart. FEBS Journal, 275 (20): 4990-5006.

  22. Trofimova L.K., Graf A.V., Klimuk E.I., Kabysheva M.S., Sokolova N.A., Bunik V.I. (2008) Phosphonate analogue of ketoglutarate increases activity of ketoglutarate dehydrogenasecomplex in situ and in vivo. European Neuropsychopharmacology, 18: S254-S255.

  23. Bunik V.I., Degtyarev D. (2008) Structure-function relationships in the 2-oxo acid dehydrogenase family: Substrate-specific signatures and functional predictions for the 2-oxoglutarate dehydrogenase-like proteins. Proteins-Structure Function and Bioinformatics, 71 (2): 874-890.

  24. Bunik V.I., Schloss J.V., Pinto J.T., Gibson G.E., Cooper A.J.L. (2007) Enzyme-catalyzed side reactions with molecular oxygen may contribute to cell signaling and neurodegenerative diseases. Neurochemical Research, 32 (4): 871-891.

  25. Bunik V.I., Raddatz G., Wanders R.J.A., Reiser G. (2006) Brain pyruvate and 2-oxoglutarate dehydrogenase complexes are mitochondrial targets of the CoA ester of the Refsum disease marker phytanic acid. FEBS Letters, 580 (14): 3551-3557.

  26. Santos S.S., Gibson G.E., Cooper A.J.L., Denton T.T., Thompson C.M., Bunik V.I., Alves P.M., Sonnewald U. (2006) Inhibitors of the alpha-ketoglutarate dehydrogenase complex alter [1-C-13] glucose and [U-C-13] glutamate metabolism in cerebellar granule neurons. Journal of Neuroscience Research, 83 (3): 450-458.

  27. Bunik V.I., Denton T.T., xu H., Thompson C.M., Cooper A.J.L., Gibson G.E. (2005) Phosphonate analogues of alpha-ketoglutarate inhibit the activity of the alpha-ketoglutarate dehydrogenase complex isolated from brain and in cultured cells. Biochemistry, 44 (31): 10552-10561.

  28. Gibson G.E., Blass J.P., Beal M.F., Bunik V. (2005) The alpha-ketoglutarate-dehydrogenase complex - A mediator between mitochondria and oxidative stress in neurodegeneration. Molecular Neurobiology, 31 (1): 43-63.

  29. Bunik V.I. (2003) 2-oxo acid dehydrogenase complexes in redox regulation - Role of the lipoate residues and thioredoxin. European Journal of Biochemistry, 270 (6): 1036-1042.

  30. Bunik V.I., Sievers C. (2002) Inactivation of the 2-oxo acid dehydrogenase complexes upon generation of intrinsic radical species. European Journal of Biochemistry, 269 (20): 5004-5015.

More articles