Сайт в стадии разработки [Старая версия сайта]
Самый цитируемый биологический институт РФ *

Нилов Дмитрий Константинович

с.н.с., к.х.н.
Контакт
Телефон: 8 (903) 787-76-27
Адрес: Ломоносовский корпус МГУ, Ломоносовский проспект 27к1., к. Е501
Подразделение: Лаборатория ферментативных модификаций физиологически активных соединений
Страница в ИСТИНе: nilovdm
Область научных интересов:

cтруктура и конформационная подвижность белков, механизм их взаимодействия с субстратами и ингибиторами, а также компьютерный поиск соединений - лекарственных кандидатов, способных селективно связываться с представляющими терапевтический интерес белками.

Руководитель 4 дипломных и 9 курсовых работ.

Список публикаций:

Гущина И.В., Нилов Д.К., Захаренко А.Л., Лаврик О.И., Швядас В.К. Моделирование структуры и скрининг ингибиторов тирозил-ДНК-фосфодиэстеразы 1 человека. (2017) Acta Naturae, 9, 62-69.

Zakharenko, A., Luzina, O., Koval, O., Nilov, D., Gushchina, I., Dyrkheeva, N., Švedas, V., Salakhutdinov, N., and Lavrik, O. Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 inhibitors: usnic acid enamines enhance the cytotoxic effect of camptothecin. (2016) J. Nat. Prod., 79, 2961-2967.

Нилов Д.К., Куликов А.В., Прохорова Е.А., Швядас В.К. Идентификация новых структурных фрагментов для дизайна ингибиторов лактатдегидрогеназы А. (2016) Acta Naturae, 8, 129-133.

Нилов Д.К., Тараров В.И., Куликов А.В., Захаренко А.Л., Гущина И.В., Михайлов С.Н., Лаврик О.И., Швядас В.К. Ингибирование поли(ADP-рибозо)полимеразы метаболитом нуклеиновых кислот 7-метилгуанином. (2016) Acta Naturae, 8, 120-128.

Нилов Д.К., Прохорова Е.А., Швядас В.К. Поиск ингибиторов лактатдегидрогеназы A человека с использованием компьютерного моделирования. (2015) Acta Naturae, 7, 62-68.

Grigorenko, B.L., Khrenova, M.G., Nilov, D.K., Nemukhin, A.V., and Švedas, V.K. Catalytic cycle of penicillin acylase from Escherichia coli: QM/MM modeling of chemical transformations in the enzyme active site upon penicillin G hydrolysis. (2014) ACS Catalysis, 4, 2521–2529.

Нилов Д.К., Швядас В.К. Средство для ингибирования фермента поли(АДФ-рибозо)полимеразы. (2014) Патент RU 2522915, 1-7.

Nilov, D.K., Shabalin, I.G., Popov, V.O., and Švedas, V.K. Molecular modeling of formate dehydrogenase: the formation of the Michaelis complex. (2012) J. Biomol. Struct. Dyn., 30, 170-179.

Халиуллин И.Г., Нилов Д.К., Шаповалова И.В., Швядас В.К. Построение механистической полноатомной модели апуриновой/апиримидиновой эндонуклеазы человека APE1 для виртуального скрининга новых ингибиторов. (2012) Acta Naturae, 4, 83-89.

Захаренко А.Л., Суханова М.В., Ходырева С.Н., Новиков Ф.Н., Стройлов В.С., Нилов Д.К., Чилов Г.Г., Швядас В.К., Лаврик О.И. Усовершенствованная процедура поиска потенциальных ингибиторов поли(АДФ-рибозо)-полимеразы-1 с использованием молекулярного докинга. (2011) Молекуляр. биология, 45, 565-569.

Нилов Д.К., Шабалин И.Г., Попов В.О. Швядас В.К. Изучение транспорта формиата через субстратный канал формиатдегидрогеназы при помощи управляемой молекулярной динамики. (2011) Биохимия, 76, 211-213.